Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tuba8Q9JJZ2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms