Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trim39Q9ESN2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trim39Q9ESN2 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trim39Q9ESN2 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trim39Q9ESN2 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trim39Q9ESN2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trim39Q9ESN2 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trim39Q9ESN2 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trim39Q9ESN2 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trim39Q9ESN2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trim39Q9ESN2 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trim39Q9ESN2 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trim39Q9ESN2 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trim39Q9ESN2 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trim39Q9ESN2 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trim39Q9ESN2 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trim39Q9ESN2 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trim39Q9ESN2 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trim39Q9ESN2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trim39Q9ESN2 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trim39Q9ESN2 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trim39Q9ESN2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trim39Q9ESN2 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Trim39Q9ESN2 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trim39Q9ESN2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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