Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn4aQ9ER60 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn4aQ9ER60 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn4aQ9ER60 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn4aQ9ER60 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn4aQ9ER60 Gm18391-201ENSMUST00000217189 658 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn4aQ9ER60 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn4aQ9ER60 AC159006.3-201ENSMUST00000226918 664 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn4aQ9ER60 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn4aQ9ER60 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn4aQ9ER60 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn4aQ9ER60 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn4aQ9ER60 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn4aQ9ER60 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn4aQ9ER60 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn4aQ9ER60 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn4aQ9ER60 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn4aQ9ER60 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn4aQ9ER60 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn4aQ9ER60 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn4aQ9ER60 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn4aQ9ER60 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn4aQ9ER60 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn4aQ9ER60 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn4aQ9ER60 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn4aQ9ER60 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn4aQ9ER60 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn4aQ9ER60 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn4aQ9ER60 Gm13134-201ENSMUST00000132106 738 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn4aQ9ER60 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn4aQ9ER60 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn4aQ9ER60 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn4aQ9ER60 Gm23458-201ENSMUST00000083257 169 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn4aQ9ER60 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Gm9095-201ENSMUST00000117607 881 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Gm9097-201ENSMUST00000120514 880 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Defa-ps16-201ENSMUST00000121939 171 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Ighv5-12-4-201ENSMUST00000195381 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Gm8828-201ENSMUST00000196786 1290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 CT009550.1-201ENSMUST00000225750 864 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Gm14227-201ENSMUST00000119431 629 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Gm7815-201ENSMUST00000196104 832 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Gm8914-201ENSMUST00000101396 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Gm5071-201ENSMUST00000104922 1035 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scn4aQ9ER60 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms