Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Mir669p-2-201ENSMUST00000103868 87 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Mir669p-1-201ENSMUST00000103884 87 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Gm18529-201ENSMUST00000193025 1257 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Gm6841-201ENSMUST00000220602 598 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 AC154603.2-201ENSMUST00000223896 577 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnn1Q9EQR3 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Kcnn1Q9EQR3 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Kcnn1Q9EQR3 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm7631-201ENSMUST00000196935 1100 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Kcnn1Q9EQR3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm7073-201ENSMUST00000114687 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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