Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rhox9Q9EQM5 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms