Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms