Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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SrpraQ9DBG7 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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SrpraQ9DBG7 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SrpraQ9DBG7 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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