Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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Smg9Q9DB90 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
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Smg9Q9DB90 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
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Smg9Q9DB90 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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