Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf138rt1Q9D9M9 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms