Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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Pdzd9Q9D9M4 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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