Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tvp23bQ9D8T4 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tvp23bQ9D8T4 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms