Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Bbs7-202ENSMUST00000108155 2437 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12576-201ENSMUST00000135268 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c6Q9D8P7 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms