Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
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Cldn23Q9D7D7 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Cldn23Q9D7D7 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Cldn23Q9D7D7 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Cldn23Q9D7D7 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn23Q9D7D7 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms