Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MsraQ9D6Y7 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MsraQ9D6Y7 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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