Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ttc9bQ9D6E4 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ttc9bQ9D6E4 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ttc9bQ9D6E4 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ttc9bQ9D6E4 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ttc9bQ9D6E4 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ttc9bQ9D6E4 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ttc9bQ9D6E4 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ttc9bQ9D6E4 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ttc9bQ9D6E4 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ttc9bQ9D6E4 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Ttc9bQ9D6E4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc9bQ9D6E4 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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