Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Phf6Q9D4J7 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Phf6Q9D4J7 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Phf6Q9D4J7 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Phf6Q9D4J7 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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Phf6Q9D4J7 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Phf6Q9D4J7 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms