Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
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Tmed11Q9D2R4 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Tmed11Q9D2R4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Tmed11Q9D2R4 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
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Tmed11Q9D2R4 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms