Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Syf2Q9D198 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms