Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms