Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Exo5Q9CXP9 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Exo5Q9CXP9 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms