Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms