Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pin4Q9CWW6 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pin4Q9CWW6 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pin4Q9CWW6 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pin4Q9CWW6 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pin4Q9CWW6 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pin4Q9CWW6 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pin4Q9CWW6 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pin4Q9CWW6 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pin4Q9CWW6 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pin4Q9CWW6 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pin4Q9CWW6 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pin4Q9CWW6 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pin4Q9CWW6 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pin4Q9CWW6 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pin4Q9CWW6 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pin4Q9CWW6 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pin4Q9CWW6 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pin4Q9CWW6 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pin4Q9CWW6 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pin4Q9CWW6 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pin4Q9CWW6 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pin4Q9CWW6 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pin4Q9CWW6 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pin4Q9CWW6 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pin4Q9CWW6 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pin4Q9CWW6 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pin4Q9CWW6 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pin4Q9CWW6 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pin4Q9CWW6 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pin4Q9CWW6 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pin4Q9CWW6 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms