Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Khdc3Q9CWU5 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Khdc3Q9CWU5 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Khdc3Q9CWU5 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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