Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
NubplQ9CWD8 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms