Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVR1

Gm26657, Predicted gene, 26657 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26657Q9CVR1 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm26657Q9CVR1 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms