Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Atxn3Q9CVD2 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Atxn3Q9CVD2 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Atxn3Q9CVD2 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Atxn3Q9CVD2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Atxn3Q9CVD2 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Atxn3Q9CVD2 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Atxn3Q9CVD2 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Atxn3Q9CVD2 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Atxn3Q9CVD2 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms