Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms