Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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