Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms