Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms