Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdac9Q99N13 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdac9Q99N13 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdac9Q99N13 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdac9Q99N13 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdac9Q99N13 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdac9Q99N13 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Hdac9Q99N13 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdac9Q99N13 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdac9Q99N13 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdac9Q99N13 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdac9Q99N13 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdac9Q99N13 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdac9Q99N13 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdac9Q99N13 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdac9Q99N13 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdac9Q99N13 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdac9Q99N13 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdac9Q99N13 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdac9Q99N13 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdac9Q99N13 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdac9Q99N13 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdac9Q99N13 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdac9Q99N13 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdac9Q99N13 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdac9Q99N13 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdac9Q99N13 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdac9Q99N13 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdac9Q99N13 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdac9Q99N13 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Hdac9Q99N13 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Hdac9Q99N13 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Hdac9Q99N13 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Hdac9Q99N13 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Hdac9Q99N13 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hdac9Q99N13 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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