Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Sh3bp5lQ99LH9 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Sh3bp5lQ99LH9 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Sh3bp5lQ99LH9 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Sh3bp5lQ99LH9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Sh3bp5lQ99LH9 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Sh3bp5lQ99LH9 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Sh3bp5lQ99LH9 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Sh3bp5lQ99LH9 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
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Sh3bp5lQ99LH9 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Sh3bp5lQ99LH9 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Sh3bp5lQ99LH9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Sh3bp5lQ99LH9 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Sh3bp5lQ99LH9 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
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Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Sh3bp5lQ99LH9 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sh3bp5lQ99LH9 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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