Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ciao1Q99KN2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ciao1Q99KN2 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ciao1Q99KN2 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ciao1Q99KN2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ciao1Q99KN2 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ciao1Q99KN2 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ciao1Q99KN2 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ciao1Q99KN2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Ciao1Q99KN2 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ciao1Q99KN2 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ciao1Q99KN2 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ciao1Q99KN2 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Ciao1Q99KN2 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ciao1Q99KN2 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ciao1Q99KN2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ciao1Q99KN2 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ciao1Q99KN2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ciao1Q99KN2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ciao1Q99KN2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ciao1Q99KN2 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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