Protein–RNA interactions for Protein: Q99J85

Nptxr, Neuronal pentraxin receptor, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NptxrQ99J85 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NptxrQ99J85 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms