Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms