Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Smim11aQ99J19 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Smim11aQ99J19 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Smim11aQ99J19 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Smim11aQ99J19 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Smim11aQ99J19 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Smim11aQ99J19 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Smim11aQ99J19 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Smim11aQ99J19 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim11aQ99J19 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Smim11aQ99J19 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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