Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Gm17541-201ENSMUST00000080062 525 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Csmd1Q923L3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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