Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Sh3bgrl3Q91VW3 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms