Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms