Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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Slc6a20aQ8VDB9 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Slc6a20aQ8VDB9 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Slc6a20aQ8VDB9 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Slc6a20aQ8VDB9 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Slc6a20aQ8VDB9 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Slc6a20aQ8VDB9 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Slc6a20aQ8VDB9 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Slc6a20aQ8VDB9 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Slc6a20aQ8VDB9 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Slc6a20aQ8VDB9 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.9 ms