Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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