Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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LgsnQ8CIX8 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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LgsnQ8CIX8 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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LgsnQ8CIX8 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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LgsnQ8CIX8 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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LgsnQ8CIX8 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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LgsnQ8CIX8 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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LgsnQ8CIX8 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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LgsnQ8CIX8 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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LgsnQ8CIX8 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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LgsnQ8CIX8 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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LgsnQ8CIX8 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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LgsnQ8CIX8 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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LgsnQ8CIX8 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LgsnQ8CIX8 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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