Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Brf1Q8CFK2 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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