Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Hpf1Q8CFE2 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Hpf1Q8CFE2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Hpf1Q8CFE2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Hpf1Q8CFE2 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Hpf1Q8CFE2 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Hpf1Q8CFE2 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hpf1Q8CFE2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
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