Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ercc8Q8CFD5 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Ercc8Q8CFD5 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Ercc8Q8CFD5 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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Ercc8Q8CFD5 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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Ercc8Q8CFD5 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
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Ercc8Q8CFD5 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
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Ercc8Q8CFD5 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
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