Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cdkl1Q8CEQ0 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms