Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms