Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Nhlrc3Q8CCH2 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Nhlrc3Q8CCH2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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