Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBG9

Rnf170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, mousemouse

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Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf170Q8CBG9 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Rnf170Q8CBG9 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf170Q8CBG9 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Rnf170Q8CBG9 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Rnf170Q8CBG9 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Rnf170Q8CBG9 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Rnf170Q8CBG9 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Rnf170Q8CBG9 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Rnf170Q8CBG9 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf170Q8CBG9 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf170Q8CBG9 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf170Q8CBG9 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf170Q8CBG9 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf170Q8CBG9 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Rnf170Q8CBG9 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Rnf170Q8CBG9 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms