Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp54Q8BL06 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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